「38」は結論ではなく、精査の始まり

2026年3月9日、海洋研究開発機構（JAMSTEC）とNippon Foundation–Nekton Ocean Censusは、日本周辺の二つの深海域から新種38種を確認し、さらに28種を「新種の可能性が高い」と判断したと発表した。海底を照らしたのは前年6月だった。標本を並べ、顕微鏡像、体の構造、既知種の記載、DNA配列を突き合わせる作業を経て、数字が公表された。

ここで最初に守るべき区別がある。JAMSTECがいう「新種」は、専門の分類学者が精査し、まだ学名のない未記載種だと判断したものを指す。しかし38種すべてが、すでに正式な学名を与えられ、査読論文で記載されたという意味ではない。発表時点で多くは論文化の途中にあり、二つのカテゴリーの差は「専門家が未記載種と確定したか」「なお追加比較が必要か」にある。

同じように「528」は個体数ではなく、JAMSTECの原文では528を超える標本ロットである。一つのロットに複数個体が含まれることもあれば、組織や微小生物を別の保存法で管理することもある。そして南海トラフで確認された80種は、今回の全新種数ではない。既知種、国内初記録、分布拡大、新種を含む、五つの冷湧水地点の総合的な動物相リストだ。

38種分類学者が学名のない未記載種と判断。
28種新種の可能性が高いが、追加精査が必要。
528ロット超採集・画像化・保存された標本単位。
80種南海トラフ5冷湧水域で記録した全動物種。

20日間、10潜航、海底で使える時間

調査は2025年6月4日から23日までの20日間。深海潜水調査船支援母船「よこすか」から有人潜水調査船「しんかい6500」を投入し、Ocean Censusの航海記録によれば10回の潜航を実施した。チームにはJAMSTEC、Ocean Census、名古屋大学、北海道大学、オーストラリア国立大学などの研究者が加わった。

水深6500メートルへの一日は、海底だけの八時間ではない。「しんかい6500」は毎分約45メートルで下降し、最大深度まで約2時間半、浮上にも同程度を要する。通常の潜航時間は下降・上昇込みで8時間。最深部では、研究者が窓から観察し、二本のマニピュレーターで狙った生物や基質を採る時間は短い。七つのサーチライトを点灯しても、良好な海況で見えるのはおよそ10メートル先までだ。

だから、標本数を増やすだけでは足りない。海綿の内側に生物がいるのか、サンゴと甲殻類がどの位置関係にあるのか、冷湧水の炭酸塩地形のどこに貝が集まるのか――生物学者が現場を見て採集対象を選ぶことで、標本と生息状況を結びつける。JAMSTECは、この直接観察と、異なる分類群の専門家が同じ地点を多角的に見ることが、限られた潜航から多様な種を回収できた理由だと説明している。

深海で「何を採ったか」と同じほど重要なのが、「どこで、何と一緒に、どのように生きていたか」である。

一つの航海で、二つの別世界へ

航海は、生態学的に異なる二つの地形を結んだ。南海トラフは駿河湾から日向灘沖へ伸びるプレート境界で、地震・地殻変動の研究では世界的に知られる。海底ではメタンを含む流体が低温のまま染み出す「冷湧水」が点在する。七曜海山列は東京の南東約500～700キロ、伊豆・小笠原弧に並ぶ火山性の海山群で、硬い岩盤、急斜面、頂部、流れの違いがモザイク状の生息場所をつくる。

南海トラフでは既知の冷湧水地点を系統的に比べることが主眼だった。一方、七曜海山列では、生物学的な現地調査がほとんど、あるいは全く行われていなかった日曜、月曜、火曜、金曜海山に「しんかい6500」が入った。片方は研究されてきた地震帯の生物学的な空白、もう片方は地図に名があっても生態系が見られていなかった海山である。

海域エネルギーと地形2025年調査の焦点主な成果
南海トラフプレート境界、メタン冷湧水、軟泥・炭酸塩基質水深600～4600mの5地点を統一的に調査従来14種から計80種へ。分布拡大、国内初記録、未知の種間関係
七曜海山列火山性海山、岩盤、斜面、局地的な流れ未踏だった日曜・月曜・火曜・金曜海山海綿群集、サンゴ群集、新種コシオリエビ5種、海綿内共生ゴカイ

南海トラフ――14種から80種へ

査読誌Ecosphereに2025年11月に掲載されたChong Chen氏らの研究は、南海トラフの冷湧水生物を初めて五地点で統一的に比較した。第二天竜海丘（約600メートル）、竜洋海底谷（約1000メートル）、大峯リッジ（約2000メートル）、熊野沖の結城リッジ（約2500メートル）、室戸岬沖（約4600メートル）である。

過去の文献でこの五地点から知られていた冷湧水関連動物は計14種、地点ごとには1～6種だった。新調査は計80種、地点ごとに15～30種を記録した。内訳は軟体動物33種、環形動物23種、節足動物11種、ヒモムシ5種、棘皮動物4種、刺胞動物3種、コケムシ1種。単純計算では従来記録の約5.7倍であり、「5倍増」という発表表現より正確には、記録された多様性が5倍を超えたといえる。

これは数年の間に生物が急増したという意味ではない。以前からいた生物を、比較可能な設計、有人観察、細かな採集、複数分類群の専門家によって見つけたのである。調査努力が増えれば種数が増える「サンプリング効果」は当然含まれる。しかし、その効果こそ、この地域の生物学的基礎台帳がいかに薄かったかを示す。80種という値は最終的な上限ではなく、初めて置かれた信頼できる出発点に近い。

太陽のない食物網――冷湧水の化学合成

海の表層では、植物プランクトンが日光を使って有機物をつくり、それが深海へ沈む。ところが冷湧水では、微生物がメタンや硫化水素などの還元物質を酸化して得るエネルギーで炭素を固定する。化学合成微生物そのものを食べる動物もいれば、二枚貝やハオリムシの体内・体表に共生して栄養を供給するものもいる。暗闇に、局地的に密度の高い生態系が成立する理由だ。

「冷」という名は、熱水噴出孔の高温流体と対比したもので、生命活動が低いという意味ではない。湧出量、化学組成、底質、深度、流れが変われば、微生物と動物の組み合わせも変わる。五地点を水深600～4600メートルまで並べた今回の調査は、単に珍しい生物の写真を集めるのではなく、同じ南海トラフの中で群集がどう入れ替わるかを比較できる設計だった。

南海トラフでは地震観測や地質調査が蓄積してきた一方、生物多様性を主目的とした広域調査は乏しかった。地震研究が「海底がどう動くか」を問うなら、生物調査は「その海底で何が生き、変化にどう応答するか」を問う。二つは競合しない。地形、流体、生物を同じ地図上で読むことで、初めて冷湧水生態系の全体像に近づく。

七曜海山列――海綿の森とサンゴの庭

七曜海山列で照明の中に現れたのは、高密度の海綿群集と冷水性サンゴの群落だった。海山は深海平原から突き出す島のような地形で、流れを変え、懸濁する餌を運び、岩盤を必要とする固着生物へ足場を与える。同時に海山ごとの隔離は、限られた分散能力しか持たない生物に独自の進化史を与える可能性がある。

調査ではMunidopsis属を含むコシオリエビ類の新種5種、八放サンゴ、ヒモムシ、ヨコエビ、腹足類、動吻動物などに新しい観察・採集記録が得られた。日本近海で初めて確認された種、従来は希少とされた種も含まれる。だが公表資料は38種すべての学名付き目録をまだ示していない。写真映えする大型動物だけでなく、堆積物の隙間に住む線虫、カイアシ類、緩歩動物、原生生物など微小底生生物も採集対象だった。

この点は、海山を一つの「宝箱」として描く誘惑を抑える。新種の数は、どの分類群の専門家が参加し、どの網目・保存法・DNA手法を使ったかで変わる。2025年の航海が示したのは、七曜海山列の生物相を数え終えたことではない。四つの海山を初めて精密に覗き、未知の規模を測り始めたことである。

「ガラスの城」に住む二つのゴカイ

月曜海山で採集された六放海綿、いわゆるガラス海綿は、二酸化ケイ素から精巧な骨格をつくる。その内部に、同じ海綿をすみかとする二種のヘシオン科ゴカイがいた。形態と分子系統を統合した研究により、Dalhousiella yabukiiとLeocratides watanabeaeとして2026年3月9日に正式発表された。

面白さは、新種が二つという数だけではない。系統解析は、ヘシオン科で海綿と共生する性質が両属の共通祖先に一度生じた可能性を示した。しかし二種は互いに最も近い親戚ではなく、それぞれ別の姉妹群に属する。同じ希少なガラス海綿という住み場所へ、近縁な系統が独立に似た生態的特殊化を進めた「収斂的な宿主利用」が示唆された。

潜水船の窓と映像がなければ、保存瓶の中のゴカイが同じ海綿内で暮らしていたという関係は失われやすい。逆に、映像だけでは新種を確定できない。繊毛、剛毛、顎、体節などの微細形態を比較し、DNAで系統的位置を検討し、標本を保存する。現場観察と博物館型の分類学がつながったとき、「奇妙な虫」は進化の仮説を検証できる証拠になる。

「新種確認」から正式な名前まで

分類学者が標本を見て「既知のどの種にも当てはまらない」と判断することと、動物命名法国際審議会（ICZN）の規則に沿って新しい学名を成立させることは別の段階である。まず形態を詳細に記載し、近縁種の論文やタイプ標本と比較する。DNA配列は強力な証拠だが、単一のバーコード差だけで機械的に種が決まるわけではない。

そのうえで、識別できる診断形質、学名、語源、産地、生息情報を論文に示し、学名を担うホロタイプまたはタイプ系列を明示し、将来の研究者が調べられる公的コレクションへ収蔵する。電子出版ではZooBank登録など、規則上の追加条件もある。査読者は既知種との重複、比較資料の不足、系統解析の解釈を点検する。

段階何が分かった状態か今回の数字との関係
採集・観察生物を場所・映像・環境データと結び、標本を保存528ロット超
仮同定科・属・既知種候補へ振り分けるワークショップの入口
新種候補未記載の可能性が高いが比較不足28種
未記載種と確認専門家が既知種ではないと判断38種
正式記載診断、学名、タイプ、出版が命名規約を満たす論文ごとに進行。ガラス海綿の2種は完了

したがって「38種が確認された」は広報上の誇張ではないが、「38種の正式命名が完了した」と書き換えてはいけない。発見は海底で起こり、確認は研究室と専門家会議で進み、学名は永続的な証拠と出版によって成立する。どれも必要で、時計の速さが違う。

標本を人へ運ぶ――分類学ワークショップ

潜航に乗れるのは、パイロット2人と研究者1人だけである。航海全体でも参加人数には限界があり、軟体動物、環形動物、甲殻類、ヒモムシ、サンゴ、海綿、微小動物の専門家を全員乗せることはできない。そこで2025年9月29日から10月10日、国内外の分類学者が横須賀のJAMSTECに集まり、標本を同時に精査した。

ワークショップ方式の価値は速度だけではない。ある研究者が「幼体」と見た標本を、別の分類群の専門家が別属と見抜くことがある。DNAの結果と形態が食い違えば、保存状態、汚染、隠蔽種、既存分類の問題をその場で議論できる。複数の標本を必要な専門家へ分配しながら、データとタイプ候補の所在を一元管理することも重要だ。

Ocean Censusは、こうした航海、種発見ワークショップ、画像、遺伝情報、公開データ基盤を一つの流れにして、従来は何年も棚に眠り得た標本の記載を速めようとしている。ただし速さは規則の省略ではない。標本の品質、比較の厚み、名前の安定性を保ちながら、専門家が出会うまでの待ち時間を短くする試みである。

深海に人が潜る意味

深海調査には、無人探査機（ROV）、自律型無人探査機（AUV）、採泥器、トロール、環境DNAなど多くの方法がある。有人潜水船が常に最善ということではない。広域測量、長時間観測、高リスク地点では無人機が優れ、採泥器は小さな底生生物を定量的に取れる。

それでも「しんかい6500」が提供するのは、研究者が立体感と周辺視野を持ち、予想外の関係をその場で判断できる環境だ。海綿をただ切り取るのではなく、内部の生物を逃さない向きで、周囲の映像を残しながら採る。異常な個体を見つけたとき、計画を変えて同じ基質の反復標本を取る。2025年調査ではこの選択性が、海綿共生や群集構造を読み解く鍵になった。

一方で窓から見える範囲は狭く、研究者の関心による偏りも生まれる。目立たない泥中生物は見落とされやすい。最良の設計は「有人か無人か」の勝負ではなく、有人の判断、ROVの持続時間、AUVの地図、定量採泥、DNA、長期観測を組み合わせることだ。

「生命のいない深海」から150年

19世紀前半、深い海では高圧と暗闇のため生命が存在できないという説が欧州科学界で真剣に論じられた。1872～76年の英国軍艦チャレンジャー号による世界航海は、7キロを超えるロープで測深・採集を行い、深海から多数の動物を回収した。航海標本から4700種を超える新種が記載され、深海無生物説を過去のものにした。1875年には日本へ寄港し、その後太平洋を横断した。

次の大転換は1977年、有人潜水船Alvinがガラパゴス海嶺の熱水域で、日光から切り離された豊かな動物群集を目撃したことだった。生命は表層から落ちる有機物だけでなく、地球内部から供給される化学エネルギーでも大規模な生態系を築ける。今日の南海トラフ冷湧水研究は、この発見が開いた化学合成生態系研究の延長にある。

ただし探査史を単純な英雄物語にするべきではない。チャレンジャー号の時代の採集は、植民地主義的な航海網と切り離せず、当時の記録には今日受け入れられない人種観も残る。現代の海洋生物発見には、標本・データをどこが所有し、誰が学名を決め、沿岸国と地域社会が成果へどうアクセスするかという公平性も求められる。日本の排他的経済水域で得た成果を公開基盤へ載せる計画には、その現代的責任がある。

日本の深海科学――「しんかい2000」から6500へ

JAMSTECの前身、海洋科学技術センターは1971年10月に設立された。1981年、日本初の本格的な深海研究有人潜水船「しんかい2000」が完成し、1983年に研究潜航を開始した。1984年、相模湾初島沖の水深約1100メートルでシロウリガイ群集を発見する。日本近海の冷湧水・化学合成生態系研究を象徴する出来事だった。

1989年には沖縄トラフで日本初のブラックスモーカーを発見。1990年4月、支援母船「よこすか」と「しんかい6500」システムが完成し、1991年に研究任務を始めた。「しんかい2000」は2002年11月の1411回目を最後に潜航を終え、2004年に退役した。技術と運用経験は6500、ROV「かいこう」などへ継承された。

「しんかい6500」の耐圧殻は内径2メートルのチタン合金球で、パイロット2人と研究者1人が入る。水深6500メートルでは約681気圧に耐えなければならない。2025年までに1800回を超えて潜航し、太平洋だけでなく大西洋、インド洋でも地質・生物研究を行ってきた。2025年の10潜航は、突然現れた技術の奇跡ではなく、半世紀にわたる船、整備、標本、データ、人材の制度の上に成り立った。

年節目今回につながる意味
1872–76チャレンジャー号世界航海深海にも多様な生命がいることを標本で示す
1977Alvinが熱水生態系を観察太陽光に依存しない食物網を認識
1971海洋科学技術センター設立日本の深海技術を継続運用する制度
1981–84「しんかい2000」完成、初島沖シロウリガイ群集日本近海の化学合成生態系研究が前進
1990–91「よこすか」「しんかい6500」完成、研究開始6500m級の直接観察・精密採集
2023Ocean Census始動航海、分類、公開データを国際的に接続
202520日間・10潜航、秋の分類ワークショップ528ロット超を38新種・28候補へ整理
2026論文と3月の成果発表80種の冷湧水台帳と正式記載が公開段階へ

基礎台帳は、守る対象を初めて見えるようにする

生物多様性の「ベースライン」は、開発に賛成か反対かを自動的に決める答えではない。ある時点で、どの種がどこに、どの密度で、どの関係を持っていたかを記録する物差しである。物差しがなければ、将来の変化が自然変動か、地震や湧出の変化か、人間活動の影響かを区別できない。

JAMSTECは、メタンハイドレートを含む海底資源開発や洋上風力など、人間活動が深海を含む海洋生態系へ影響し得ると指摘する。これは今回の五つの冷湧水や四海山で具体的な開発が決まったという主張ではない。調査前の知識が乏しいまま影響評価を始める危険を示している。特に成長が遅いサンゴ・海綿群集、局所分布の共生種は、損傷後の回復時間や代替生息地の有無が分からないこと自体がリスクになる。

公開データも保全の一部だ。位置、深度、画像、標本番号、DNA、同定履歴を検索可能にすれば、別の研究者が誤同定を修正し、将来の再調査と比較できる。ただし希少種の精密位置は乱獲や採集圧を招く場合があり、公開性と保護を調整する必要もある。オープンサイエンスとは、無条件に全データを即時公開することではなく、再利用可能性、標本の追跡性、適切な保護を設計することだ。

この調査が示したこと、まだ示していないこと

証拠が示すことまだ言えないこと
二海域の標本から38未記載種、28有力候補を分類学者が認定した38種すべての正式命名と完全な学名目録が終わった
五つの南海トラフ冷湧水で計80動物種を記録した80種すべてが新種、または地域全体の最終種数である
七曜海山列の四海山に豊かな海綿・サンゴ群集があった七曜海山列全体の生物量・固有性・保全状態が確定した
有人観察が共生関係を残した精密採集に有効だった有人潜水船が全ての深海調査で無人機より優れる
開発前の基礎台帳として価値がある特定事業の影響、または特定保護区の境界を単独で決められる

世界で正式に記載された海洋生物は約24万種とされ、実際には数百万種がいるという推定もある。しかし未発見率は分類群、深度、推定法で大きく変わる。「海の90%が未知」といった単一の標語は、観測範囲、地図、生態、種記載を混同しやすい。今回の最も強い証拠は、地球全体の未知率ではなく、日本の具体的な九つの地点を系統的に調べただけで、これほど多くの未記載種が見つかったという事実だ。

名前を与えることは、忘れない仕組みをつくること

新種のニュースは、怪物のような形や鮮やかな色で消費されがちだ。だが分類学の成果は、驚きを標準化された知識へ変えることにある。名前があれば、別の航海の標本、漁業記録、環境DNA、保全評価、進化研究が同じ生物について話せる。タイプ標本があれば、将来分類が変わっても、その名前が何を指したかへ戻れる。

38種という数字は、日本の深海が「発見された」ことを意味しない。むしろ、10回の潜航で未知がこれだけ表面化したことが、未調査域の広さを示す。28の候補は追加標本や比較を待ち、38の未記載種は論文とタイプ標本を待つ。80種の冷湧水リストは季節、幼生、微小動物、時間変化を追う次の調査を待つ。

チャレンジャー号のロープから「しんかい6500」のチタン球まで、深海探査は見える範囲を伸ばしてきた。だが発見を持続するのは、潜水船だけではない。標本庫、分類学者、船員、技術者、公開データ、次の世代の専門家である。「ガラスの城」に住む虫へ名前を与えることは、その小さな生命を世界の共有記憶に組み込むことだ。日本の深海から上がった528ロットは、海底からの帰還で終わらない。ここから、長い科学の航海が始まる。

主な資料・参考文献

編集注：「確認された新種」はJAMSTECの定義に従い、分類学者が学名のない未記載種と判断したものを指します。38種すべての正式記載完了を意味しません。528は標本ロット、80は南海トラフ五地点の全記録種です。深海開発に関する記述は一般的なベースラインの必要性であり、調査地点に特定事業が決定したという意味ではありません。ヒーロー画像は編集イラストで、現場写真ではありません。